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重庆发布全球首个高糖血橙高质量基因组

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日期:2024-05-20

5月17日,从市农科院传来消息,该院果树所柑橘创新团队发布了国际首个血橙高质量基因组,相关研究成果日前在国际权威期刊《Scientific Data》(中文译名《科学数据》)上发表。

血橙属于甜橙类品种,其富含的花青素能够延缓衰老,受到消费者普遍青睐。市特色水果产业技术体系创新团队首席专家孔文斌说,目前国内的血橙主要在川渝地区种植,总的种植面积超过100万亩,其中重庆有40万余亩,“这个体量在我市整个柑橘产业中排名第二,仅次于脐橙,涉及果农10万户左右。”

在生产中,现主栽血橙品种多为意大利“塔罗科”品种变异而来的“塔罗科”新系,目前存在品质不稳定等问题。

为了改良品种,近年来市农科院果树所柑橘创新团队潜心开展自主品种选育。2019年,他们在育种资源中偶然发现了一株自然变异株,其花青素含量更高,血色更深,糖度也更高。

团队随即在该优良变异资源的基础上进行嫁接实验。经过连续4年试验观察,发现其性状稳定、特色鲜明,目前正在申请国家新品种权保护和品种登记,暂命名为“内秀”。

“通过实验室检测分析,我们发现‘内秀’确实在甜度和花青素含量等方面都超过了‘塔罗科’新系。但由于这是自然变异而来,我们也在思考这背后到底是什么基因在起作用。”市农科院果树所柑橘创新团队首席专家洪林说。

由于国际上尚未有公开发布的高质量的血橙基因组,团队采用目前最先进的三代基因测序技术,启动了“内秀”血橙全基因组测序工作,通过对血橙基因的研究、挖掘、利用,为后续育种提供素材和方向。

洪林介绍,此次团队对血橙基因测序深度达到65×,共预测到30395个基因。“65×的深度可以很好地覆盖基因组的完整信息,这意味着我们检测到的基因完整度、精确度更高。目前完整性达到98.2%,可以说是一组高质量的基因组。”

据悉,团队现已利用该血橙基因组,与已公布的橙子、柚子、橘子等柑橘基因组进行了比较分析,成功发现了影响血橙花青素合成能力的一些变异基因。

洪林表示,未来将通过对血橙基因组信息的深入研究,不断揭开血橙基因的奥秘,发掘更多有用的优异基因资源,为血橙乃至其他作物的生物育种提供帮助。

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